O piloto português, que teve uma excelente prestação na qualificação para a corrida 1 no Japão, perdeu a pole devido a uma penalização. O piloto luso foi penalizado por ter sido considerado que guiou de forma demasiado lenta.
A qualificação foi marcada pela muita chuva que caiu de forma continua e os pilotos tentaram encontrar espaço na curta pista de Suzuka (numa versão modificada). Tiago Monteiro terá guiado de forma muito lenta e foi penalizado tal como, Augusto Farfus, Norbert Michelisz, Gabriele Tarquini, Nestor Girolami, Daniel Hagelof, Aurelien Panis e Jim Ka To e outros 13 pilotos foram repreendidos.
Tom Coronel foi desclassificado devido a uma infracção no reabastecimento do carro (feito com o piloto no carro e sem as medidas de segurança exigidas).
Esteban Guerrieri herdou assim a pole para a corrida 1:
