Casey Stoner foi a figura dominante da segunda sessão de treinos livres em Aragon, que ficou marcada pela forte chuva. O australiano da Ducati registou o tempo de 2.01,710s num último esforço para bater Jorge Lorenzo, que se ficou, assim, pelo segundo posto.
Durante a sessão de 45 minutos Nicky Hayden, também em Ducati, conseguiu o terceiro melhor tempo, seguido de perto por Valentino Rossi. Marco Melandri, na Honda da Gressini, surpreendeu ao registar o quinto melhor tempo enquanto Dani Pedrosa se ficou pelo 13º posto.
Tempos:
1. Casey Stoner Ducati 2m01.710s
2. Jorge Lorenzo Yamaha 2m02.278s + 0.568s
3. Nicky Hayden Ducati 2m02.411s + 0.701s
4. Valentino Rossi Yamaha 2m02.878s + 1.168s
5. Marco Melandri Gresini Honda 2m03.146s + 1.436s
6. Andrea Dovizioso Honda 2m03.754s + 2.044s
7. Randy de Puniet LCR Honda 2m03.801s + 2.091s
8. Ben Spies Tech 3 Yamaha 2m03.874s + 2.164s
9. Hector Barbera Aspar Ducati 2m04.063s + 2.353s
10. Marco Simoncelli Gresini Honda 2m04.151s + 2.441s
11. Colin Edwards Tech 3 Yamaha 2m04.868s + 3.158s
12. Alvaro Bautista Suzuki 2m05.170s + 3.460s
13. Dani Pedrosa Honda 2m05.394s + 3.684s
14. Mika Kallio Pramac Ducati 2m06.257s + 4.547s
15. Aleix Espargaro Pramac Ducati 2m07.133s + 5.423s
16. Hiroshi Aoyama Interwetten Honda 2m07.632s + 5.922s
